二月十二日，陈华清在川北扫挡流寇时，驻于重庆的明军对盘踞在重庆府的叛军发动了攻击。
此次攻城战中，朱燮元用上了火器部队，把成都所有的大炮都调到重庆府。大炮的轰击极大地打击了奢军的士气，再加上明军准备充足，坚守了两天后，奢军放弃了重庆府，奢寅带着人逃回永宁。
收回重庆府后，意味着四川境内不再有成建制存在的叛军，明军得以腾出手解决地方上的一些事情。
杨愈懋在重庆府待了两天后，便带兵去了贵州，会合黔军镇压蠢蠢欲动的水西安氏。秦良玉把散在各处的白杆兵也召集在一起，驻守重庆府，一旦贵州有事，就带兵过去。
同时，秦良玉让人给石砫传回消息，让马钧带驻守的一部分白杆兵去川北协助陈华清清剿流寇。
原本朱燮元是想抽调龙安府的明军到川北，但被秦良玉揽下了去川北的活，毕竟自己的孙子和陈华清关系不错，合作起来也更方便。
在川北的陈华清三月份得知了马钧要来的消息后，很高兴。川北太大了，流寇又太分散了，陈华清解决了二十二个村子的流寇后能感觉到卫所军的一丝厌战情绪。
卫所军现在驻扎的村子叫李村，一个中等规模大的村子。李村的流寇有八十八人，这股八十八人的流寇有一个领头的，组织很严密，卫所军没法像对付小村子里散乱的流寇那样用偷袭战术，陈华清直接用上掷弹队，把流寇熏出来后就好解决了。
此次来川北，主要是练兵，陈华清不想有太大的伤亡，因此陈华清就驻扎在李村等着马钧的到来。
三月初三，马钧带着六百白杆兵来到李村。
此时，达县流寇基本被明军剿完的消息传遍川北，有的小村子的小股流寇自知不是明军对手，逃出村子，大村子的大股流寇开始相互联络，希望能一起对抗明军。
六百白杆兵的到来，使得川北的明军达到一千多人。陈华清在马钧来后，立刻开始着手准备进攻达县剩下的三个大村子。
秦良玉在给石砫传消息时，让人给马钧捎带了一封口信，希望马钧此次去川北能以陈华清为主。若是别人，马钧可不会答应秦良玉，即使她是自己的奶奶，但换成陈华清就另一说了，一来自己和陈华清关系不错，二来陈华清是自己妹妹喜欢的人，自己这个做哥哥的还是很疼妹妹的。
在进攻之前，陈华清把所有主事的人召集在一起开了个军事会议。会上，李明轩把自己得到的三个大村子的情况说了一遍。
“这三个村子人口都不少，村子里大的宗族都组织了青壮抵抗流寇，因此流寇不在村子里而是在村外活动。”
“流寇一共有多少人？”石当问道。
“三股流寇一共有六百多人，他们都在村外有各自的据点。”
“流寇有没有合兵？”陈华清问道。
李明轩顿了顿，说道：“这个暂时不清楚，不过三股流寇相互之间是有联系的。”
“好，那就速战速决，不要让他们反应过来。”说完陈华清又问了问坐在自己旁边的马钧：“老马，你觉得怎么样？”
马钧赞同道：“老陈，就听你的。来到这我就跟你说了，这次我是给你打下手的，不用这么客气。”
马钧的话是对在场的卫所军和白杆兵的将领们说的，由此确立了陈华清对这一千多人的主导地位。
三股流寇已经知道明军要来，但他们不知道又有另一支明军也来了，此时的他们即使合兵一处也不占任何优势，况且他们现在还在为怎么联合在扯皮，力量分散。
有了李明轩的情报，卫所军和白杆兵很轻易的就找到了其中一处流寇的据点。流寇闹起的时间不长，因此据点相当简陋，选的也不是什么险要的地形。
陈华清连掷弹队都没用，仅仅包围住据点，一步步挺进，就把这股流寇给消灭了。趁热打铁，另外两股流寇也别陈华清用同样的办法给灭了。
没办法，流寇在人数、装备、士气上都不如明军，根本不是明军的对手。
在消灭流寇后，