达摩将衣钵传给了慧可之后，就圆寂了。但是有信众在路上看见达摩西行，不但赤着脚，而且一只草鞋挂在拐杖上。慧可主持大家开棺求证师傅的行踪，打开棺木里面只要一只草鞋而已。原来达摩完成自己的任务，用假死离开中国，回自己的故乡天竺去了。
禅宗衣钵传至第五代，祖师一次出题考问众弟子。一个最低贱的苦行僧惠能竟然做了一首令祖师惊讶的佛偈：“菩提本无树，明镜亦非台。本来无一物，何处惹尘埃。”祖师觉得这个惠能的悟性特别好，但是当时的情形不能太接近惠能，这会引起众多弟子的不满。所以祖师故意训斥惠能，暗中暗示惠能晚上来方丈室找自己。
当晚祖师私下会见了惠能，考核惠能的佛理和悟性之后，决定传法于惠能。开宗明义地将佛法正宗禅理禅意传授给惠能，并将代表正宗的达摩衣钵传给了惠能，宣布惠能为禅宗六祖。并要惠能连夜下山，去南方弘法。其实是怕惠能不被这里的弟子所接受，更怕大弟子神法加害惠能。
惠能私下少林寺，但是并没有什么人关心。一个做苦力的僧人不见了，就是一件很小的事情。几天之后，大弟子神法按照规矩，请求祖师传法，正式成为禅宗第六代继承人的时候，祖师宣布传人另有其人。自己已经将祖师衣钵传于此人，神法并不是自己的正宗传人。当时就引起了大家混乱，此时佛教弟子已经不下十几万，禅宗祖师不但是禅宗之主，更是所有佛家弟子的精神领袖。神法不甘心地位就这么没有了，就秘密封锁消息，一边追杀惠能抢回祖师衣钵。祖师为了惠能的安全，依然决定提前圆寂。按照规矩祖师圆寂，要昭告天下所有的寺庙。这样一来神法不但不能阻止惠能，而且神法不能公示祖师衣钵的话，就能证明惠能真的是禅宗传人了。
惠能一路南逃，身后不但有神法的追杀，更有众多世间的烦恼。神法为了杀死惠能，故意放话出去，说惠能偷了禅宗之宝，谁要是抢回来的话他重重有赏。导致一些贪心的俗人以为惠能身上有什么金银珠宝，一路上毒杀、刺杀、追杀不断。惠能最后逃进岭南山里，过着犹如野人一样的生活。也就是在这段时间里，惠能彻底领悟了祖师的佛法。后来惠能出山，在一座茅草屋里传法授徒。这就是赫赫有名的“草庐传法”。惠能开创了南宗佛法，加快了佛法在南方地区的普及。这个岭南就是现在福建、广东一带的统称。
少林寺一直以来都是双向传承，不但是佛法的传承地，更是中国武术的传承地。早在达摩祖师在世的时候，就建议寺中弟子学武强身健体的同时护国护寺。历代少林寺主持都要选派一个高僧大德出任护寺僧，带领一些年轻的僧人学武练功。到了隋唐的时候，少林寺更是帮助当时还是秦王的李世民除去了为恶河南的王世充部，这就是名扬天下的“十三棍僧救唐王”的故事。事后李世民成为了唐朝的太宗皇帝，来少林寺感谢众位师父。少林寺众僧拒绝了所有的物质封赏，也拒绝了到朝中担任高官，只接受紫衣袈裟各一件，水碾一具。李世民为了感激少林寺，赐下嵩山少室山给少林寺，作为少林寺的佛田。并下旨允许少林寺自己组建合法的僧兵队伍，保家护院的同时，可以广收俗家弟子。
少林寺一代一代传了下来