1990/91赛季球队取得了联赛亚军的好成绩，这一年球队的的守门员创造了一项世界纪录一千二百七十五分钟不失球，打破原来意大利传奇门将左夫保持的纪录，而这一纪录一直到今天还没有人能够打破。另一方面希尔对于马竞的改造投资并没有停止，他的付出终于在1990/91赛季的杯赛中得到回报，这年他们杀入国王杯决赛，对手是皇家马洛卡，马竞以一比零力克对手捧回了第七座国王杯。
1991/92赛季俱乐部前锋马诺洛攻入二十七粒联赛进球一举夺得当年西甲联赛最佳射手，同时俱乐部在伯纳乌举行的国王杯决赛中以二比零力克皇家马德里队，捧得了第八座国王杯冠军，这也是马德里竞技与皇家马德里在杯赛决赛中四次相遇获得的第三场胜利，这年球队的联赛成绩是第三名。
1995/96赛季希尔撞大运式的请来了南斯拉夫人安蒂奇重组球队。这一年对于马德里竞技百年历史来说无疑是最辉煌的，球队赢得了历史上第一个双冠王第九个联赛冠军和第九个国王杯冠军，在西班牙国王杯赛中，马德里竞技一比零击败了如日中天的巴塞罗那，1996年的马德里竞技将俱乐部百年的历史推向了最高峰！
因为96年的冠军，马竞得以参加1996/97赛季的冠军联赛，但是遗憾的在半决赛被荷兰的阿贾克斯淘汰，联赛也未能卫冕，不过第三名的成绩仍旧捍卫着马竞西甲强队的荣誉。在国王杯半决赛中马德里竞技遭遇老对手巴塞罗那队，在卡尔德隆马德里竞技以四比五负于巴塞罗那正式退出了当年西班牙全部赛事的竞争，那场比赛被认为是马德里竞技衰退的预兆。