这次谈话之后，这对师生就没有在展开谈话，只是开始了对稿件的修改整理。围绕着三篇策论，张超和徐溥的争辩被记录下来，事实上涉及到很多理论和现实问题的看法，这次整理的过程也是一个重新学习，重新理解的过程。
可很快船就要到达南通州，张超就乘机邀请徐溥去南京，徐溥想了想，也欣然应约了。于是徐溥就住在了张超的南京家中，但是他与张超两人都闭门谢客，只专心整理稿件，却没有想到外面已经闹翻了天。
新科进士张超外放钞关主事，这通常是资深主事或者是员外郎才可以担任的职务，而且又是一等一的肥差，几乎羡慕坏了外界，朝廷如此恩宠，张超的亲戚，好友都十分欢喜，都想着给他好好庆祝一番，没想来一回南京就跟着他的座师，退休的徐阁老在整理什么稿件，真是不知道怎么说好。
徐阁老虽然退休，但是在朝野声望正隆，又到南京来了，南京的官员们当然也想跟他老人家好好聚一聚，没想到竟然待在张超家中，闭门谢客，整理什么稿件，到底是什么稿件如此重要，以至于阁老谁都不见，所有人都很好奇和诧异。
可是有一个人实在是等不及了，那就是大明医药公司新任的孙总办，张超离开南京赴考的同时，孙总办就从北京过来上任，两人未曾谋面。等到了南京后，他就发现这家大明医药公司，实在太复杂了，简直超乎了他的想象。
张超与萧敬完成交接后，自己家的人当然就离开了，南京内外廷勋贵等立刻就在公司中安插自己的人，到了此时，大明医药公司这个垄断公司经营的还是十分良好，可是张超制定的规章制度已经逐渐被破坏，各种各样的费用不知不觉间就多了起来。
孙总办是户部出身，见状不妙，他立刻拿着张超制定的规定制度，与这些人开始了斗智斗勇。可是能够来到公司的，每一个的后台都很硬，所以他用了三个多月的时间才算是理清楚了头绪，控制住了局面。
黄连素和酒精的生产基地是由御马监的人马牢牢看住，说是朝廷机密，没有汪直批准谁也别想进来，真是岂有此理。孙总办没有办法，只好暂时这么算了，不过他的弹劾早就递了上去，坚持要有个说法。
黄柏是从四川运过来的，自孙总办上任之后改成漕运，虽然损耗大了一点，但原料本来就便宜，倒也无妨。
制成品销售的代理都是张超谈好的，只要产品出来立刻就会被提走，在这个地方孙总办感受到巨大的权力，谁多谁少，谁先谁后，孙总办有一大半的话语权。连孔家的人都对他客客气气的，虽然孙总办不收礼，但心里受用呀。
孙总办不舒服的就是公司规定进出的大宗银两都要通过济世银行的账户，甚至孙总办大一点的支出也要经过济世银行。孙总办就想手里掌握一部分活钱，这样十分方便，不要总是跑银行，太麻烦了。
孙总办刚提出来修改就迎来了董事们的集体反对，这些董事甚至疑心孙总办想贪污公款，天地良心，孙总办可是有名的清官，要不然怎么会被选中来接手这个一年几十万的公司。
甚至魏国公那个浮浪的次子曾经指着孙总办的鼻子质问他到底有没有办法管好公司，为什么公司的费用自他上任以来，多了将近两倍？这可都是大家伙的钱，你敢这么浪费？
董事会的那些人要么后台非常有权势，要么非常有地位，最差的民股代表也是南京著名的商人。所以孙总办最后只好灰溜溜的再也不敢提及。
孙总办怎么也想不明白，张超那么聪明的人为什么请了一堆祖宗，架在自己头上。现在张超拍拍屁股走人了，可把他给坑苦了，他说是总办，实际上就是个伺候人的孙子。
实际上这些都不是什么大事，最大的麻烦是，自从孙总办上台后，那些流通股的价格就开始下跌，最高时超过了十多两的股票，到了此时才只有四两多一点，几个月时间竟然跌了一大半。
据孙总办的暗中了解，股票暴跌的原因一个是他带来的朝廷分红方案，