清军副将张杰、王定国奉张存仁的命令，赶赴杭州，汇集当地的清军，总兵力超过五万，占据了数量上的绝对优势。明清双方在杭州东门外大战，明军很快不敌，被迫退守富阳。清军乘势追杀，攻克富阳城。明军慌忙渡过钱塘江。此战，明军和义军损失四千余人，丢弃兵器无数。
朱以海并没有被眼前的失败吓倒，抗清意志反而更加勇敢。十一月，朱以海破格封方国安为越国公、王之仁为兴国公。二十号，朱以海在绍兴筑拜将坛，拜方国安为大将，称其为大明股肱之臣。
方国安哪受过这等礼遇，激动地跪在地上，良久不知起身，一个劲的叩头谢恩。朱以海连喊了几声，方国安才转过味儿来，又连连叩了几个头才起身。
十二月十九日，朱以海亲自来到钱塘江边军营犒赏将士，十万大军每人两钱银子、二斤肉、一壶酒。士兵们得到赏赐，自然是十分高兴、朱以海又说了许多要尽忠报国的话来激励将士，希望在日后的作战中可以逆袭，圆了他回到杭州的美梦。
五天后，方国安、马士英、王之仁留下两万人守卫江岸并负责后续接应之外，带着八万大军渡过钱塘江直扑杭州。
明军来势汹汹，但鉴于上次的战绩，这回张存仁并不觉得害怕，反而认为自己必胜无疑。
统帅有了这样的想法，自然意志坚定下来，也没有像上次逃到苏州去，而是留在杭州亲自督战。坚守杭州的同时，张存仁即令浙西和苏南的诸路满汉大军回援杭州，意图里应外合，内外夹击来犯明军。
梅勒章京朱马喇、济席哈、和托和总兵田雄、张杰、王定国先后奉命到达杭州外围。
张存仁将他们分为三路，以迎击三路明军。总兵田雄首先告捷，斩杀明军八千余人；随即各路清军战报也跟着到了张存仁的总督府。看着一份份捷报，张存仁抑制不住自己的兴奋，连连击掌大笑。张存仁明白，这次杭州大胜，对自己，对朱以海意味着什么。
朱以海满心以为，八万大军攻击杭州，即使不能全歼清兵活捉张存仁，也必然能攻克城池，使清军遭受重大打击。
抠着时间等捷报的朱以海等到的却是败兵回城。
方国安一进城，看见来迎的朱以海，扑通一声跪在地上，大哭不止，还一个劲儿的大骂自己无能。
朱以海心凉到了极点。倾举国之力，用柱国之将，面对的仅仅是清军浙江一带的地方部队，还败的如此凄惨。还谈什么恢复杭州，克复金陵？越过长江收复中原，哼哼，鬼都不信！
朱以海把所有的内侍宫女全都支开，自己一个人孤独的坐在王座之上，暗自流泪。
浙东军连续两次杭州大败，隆武朝一些文武臣工未免有些幸灾乐祸。福建军队的实际控制者郑芝龙在朝会上就公然宣称鲁王不识时务才招致大败。另外，郑芝龙也多少为鲁王挡在自己前头挨了清军的打而自己得以安枕而暗自高兴。
朱聿键却怎么也高兴不起来。论实力，鲁王与自己并不容易分出上下来，隆武朝廷虽说政令通于南方各省，但各地督抚已经成了草头王，关键时候郑芝龙能不能靠得住，朱聿键都不敢打包票。就算郑芝龙忠心耿耿，福州军真的打得过清军吗？朱聿键陷入了沉思。
突然，一个大胆的想法在他的脑海里出现：联贼御虏。这联贼御虏说白了就是联合大顺军和大西军的余部共同抗击清军。弘光朝的联虏平寇方针使得清军进入中原几乎如入无人之境，大顺军、大西军遭到清军追击，还受到明军的截杀，损失十分惨重。明朝君臣志得意满之际，清军却迅速南下，占领南京、杭州等江南重镇，使得自己在这福建重建政权也感到万分危急。
是该变变了。朱聿键决意联合农民军余部共同抗清。
第二天，朱聿键召集