无天得知悟空找到转世灵童，即命黑袍护法带二金刚前去抢夺，唐僧得知，纵身跃出轮回隧道，途遇哪吒，二人同去寻找悟空。
悟空与八戒将灵儿带回花果山，黑袍与众妖将山围定，适逢唐僧领哪吒赶来，哪吒与悟空、唐僧将二金刚击毙。黑袍带伤跑回灵山报信，无天下令各路妖魔一齐出动，夺回灵童。
唐僧师徒将灵儿转移到东华山，交碧游仙子与其师东华帝君看护。碧游与灵儿相处十分融洽，日久生情，终于碧游向灵儿吐露衷肠。灵儿对她虽有朦胧爱意，但却难忘莲花，故离开东华山在世间四处飘泊，不幸为无天所获。
无天使用黑莲圣火及其元神黑莲煅杀灵儿，竟无法伤其分毫，方知必须得到十七颗舍利子才能得逞，于是令黑袍务必在三十三天内将十七颗舍利子全部找到。
悟空等历尽千辛万苦，终于找到十六颗舍利子，不慎误中无天埋伏，急将舍利子一口吞下。无天将悟空置于沸鼎之内，意欲用烈火炼出舍利子，唐僧师徒派出能抵御弱水剧毒的八戒前去营救，悟空在烈火炙烤中开始化出舍利子，八戒救出悟空，唐僧师徒与众神汇合，与无天展开一场生死决战。
距离如来返回只有一个时辰，悟空跳入火海化为制服无天的第十七颗舍利——无骨舍利时，向无天击去，无天身形化作飞灰飞逝，如来现出金身返佛界，三界归于平静。众人齐心协力凝聚意念，悟空奇迹般地回来了。如来佛祖封孙悟空为新的万佛之祖——南无大圣舍利尊王佛。悟空打坐莲台含笑合十异常的安详。
整个剧中颠覆了西游记的理念，从顽劣不堪、任性调皮到正义勇敢、舍己为人的孙悟空，从丑陋异常到英俊潇洒的猪八戒，从佛学理论到领略了佛法真谛的唐三藏，从胆小弱势到后来担负重担，勇猛冲锋的沙悟净。
该剧改编自原著《西游记》，但并未沿用原剧中的人物角色，而是进行了大胆的改造：唐僧变成了法力无边的佛，如来佛祖和人间女子谈起了恋爱，而傻乎乎的猪八戒则成了怜香惜玉fēng_liú潇洒的汉子。
故事上，《西游记后传》讲述发生在唐僧一行取经的300年之后，此时唐僧虽已成佛，但如来佛祖圆寂后魔头无天使三界大乱，唐僧不得不为和徒弟们一起降妖伏魔而大展拳脚。
可以说是颠覆之作，被很多人误解为乱搞，但是现在在龙国，众人可不会这么想，西游问世之后，时嘉亲自发表了悟空传，引领神话中文网出现了一大波暗黑西游作品，现在这样的情形之下再出现西游记后传如此经典的暗黑封神作品，观众们的接受程度也会大大提高的！